Fullmetal Alchemist es el título del primer anime basado en el manga del mismo nombre creado porHiromu Arakawa. Se emitió desde el 4 de octubre de 2003 hasta el 2 de octubre de 2004 en Japón. Del 6 de noviembre de 2004, hasta el 18 de marzo 2006,

 se emitió una versión completa de habla inglesa de Fullmetal Alchemist en Canadá y Estados Unidos. Mientras tanto para Latinoamérica, Fullmetal Alchemist se dobló en Venezuela y es transmitida por Animax y Sony Spin. El anime sigue la trama básica del manga de Arakawa, hasta la mitad de la historia. La segunda mitad del anime Fullmetal Alchemist es drásticamente distinta del manga.


Edward y Alphonse Elric (más conocido como Ed y Al son adolescentes alquimistas con un pasado trágico. Cuando Edward tenía once años, y Alphonse sólo diez años, los hermanos trataron de traer a su madre muerta a la vida. Su intento fracasó, con un costo de que Alphonse perdiera todo su cuerpo, y Edward su pierna izquierd. En un intento desesperado por mantener a su hermano en la Tierra, Edward voluntariamente sacrificó su brazo derecho a cambio del alma de Alphonse. Edward se ve obligado a unir el alma de Al a una armadura. Al a continuación se apresuró con el cuerpo de Ed a Automail Rockbell, una empresa dirigida por amigos cercanos de los Elric. Allí, el brazo de Edward y la pierna fueron sustituidas por "Automail" (prótesis de metal que actúan como si fueran realmente miembros humanos, unidos a un cuerpo a través de una cirugía atroz y un proceso de rehabilitación).
 
Luego de un año los hermanos queman su casa para que nunca pudieran volver atrás en el camino que han elegido (una vida errante hasta que puedan recuperar sus cuerpos originales). Roy Mustangconvence a Edward para tomar el examen de Alquimista Estatal. Como un alquimista Estatal, el deber primero es a los militares o Führer, por lo que los alquimistas del Estado se conocen comúnmente como "perros de los militares." Para ayudar a su investigación, Ed tomó el examen de la Alquimia del Estado, y pasó a convertirse en un alquimista estatal. La razón principal es que Ed puede transmutar (o realizar Alquimia) sin un círculo de transmutación. Ed podría ahora tener acceso a la investigación fuera del alcance de la mayoría de la población civil. Él recibió un reloj de bolsillo que amplifica la alquimia. Ed más tarde descubre que su nombre de Alquimista estatal es "Alquimista de Acero".